В клинической стоматологии это означает заполнение корневых каналов при эндодонтическом лечении зуба, вследствие таких заболеваний зубов как периодонтит и пульпит.
Обтурация корневых каналов зуба проводится с применением гуттаперчивых штифтов и паст, которые закрывают микро-пустоты, и боковые ответвления корневых каналов. Плотность обтурации корней зуба, это гарантия от повторного инфицирования корневых каналов, через какое-то время. Хорошо обтурированные каналы корней зуба, позволяют в дальнейшем использовать корень, для фиксации штифта или культевой корневой вкладки.